从2002年起，北京市建立了流通领域食品市场准入制度，通过一系列措施，包括对37类重点食品在进入市场环节实施标准准入、协议准入、食品备案、索证索票，在食品市场交易环节实施统一检测、全程追溯、信用监管、综合执法，在食品退出市场环节实施协议退出、强制退出、限期追回、无害化处理等，有效控制食品在流通领域的全过程。
北京市建立健全了食品安全的科学评估、市场准入、监测与监督抽查、突发事件应急处理、信息归集发布和日常监督协调六项机制，对重大食品安全事件和监测抽查结果予以科学评估、综合执法、统一发布。
北京市利用现代科技手段，提高食品安全监管效能。市食品安全监控中心密切关注国内外食品安全动态，建成了覆盖内部综合业务网、北京市政务专网、互联网和移动执法网等四个网络，以及包括日常监管、信息发布、统计分析、地理信息等功能模块的首都食品安全监控系统，还在100个生产基地和企业应用了IC卡和条形码追溯系统。
